La Chiesa della Misericordia fu originariamente l’oratorio della Compagnia della SS. Annunziata, tra le più antiche confraternite religiose nate a Lucignano.

Salvata dalla soppressione degli ordini religiosi voluta dal Granduca Leopoldo, l’edificio continuò a vivere grazie all’impegno della comunità, che vi trasferì prima la Compagnia di Carità e poi l’attuale Venerabile Arciconfraternita di Misericordia, il cui stemma è ancora visibile sopra l’ingresso.

L’interno è dominato da un pregevole altare maggiore in legno intagliato e dorato, datato 1583, che occupa l’intera parete di fondo e ospita otto dipinti attribuiti alla scuola toscana tardo-cinquecentesca. Ai lati dell’aula si trovano due eleganti statue in terracotta invetriata, l’Angelo Annunciante e la Madonna Annunciata, riconducibili alla cerchia dei Della Robbia.

Le pareti laterali dell'aula sono adornate con due eleganti statue in terracotta invetriata, l'Angelo Annunciante e la Madonna Annunciata, attribuite alla cerchia dei Della Robbia. Altre tele secentesche di artisti non ancora identificati sono appese alle pareti: a sinistra, un Sant'Antonio da Padova, una Santa Teresa e una Sant'Orsola; a destra, un San Michele, una Santa Cecilia e una Maddalena.

Ad arricchire ulteriormente il complesso, nella sacrestia è stato allestito il Museo della Carità, che raccoglie arredi liturgici, abiti e strumenti impiegati nel tempo dai confratelli nei servizi di assistenza alla comunità.

La chiesa fu salvata dalla soppressione degli ordini religiosi voluta dal Granduca Leopoldo grazie all'impegno della comunità, che vi trasferì prima la Compagnia di Carità e poi l'attuale Venerabile Arciconfraternita di Misericordia, il cui stemma è ancora visibile sopra l'ingresso.

Nella sacrestia è stato recentemente allestito il Museo della Carità, dove sono esposti numerosi arredi liturgici, indumenti e suppellettili utilizzati dai membri della Confraternita nel corso dei servizi assistenziali.

La Chiesa della Misericordia rappresenta un esempio significativo di architettura religiosa rinascimentale in Toscana, arricchita da opere d'arte di notevole valore storico e artistico, e continua a essere un luogo di culto e testimonianza della devozione e della solidarietà della comunità di Lucignano.